Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARL2-SNX15V9GYD0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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ARL2-SNX15V9GYD0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
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ARL2-SNX15V9GYD0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARL2-SNX15V9GYD0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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