Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP20Q9Y6A4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP20Q9Y6A4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP20Q9Y6A4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms