Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAI2Q9Y5P3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAI2Q9Y5P3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAI2Q9Y5P3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms