Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
TRAPPC8Q9Y2L5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TRAPPC8Q9Y2L5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC35.22■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms