Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCML2Q9UQR0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML2Q9UQR0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML2Q9UQR0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms