Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SATB2Q9UPW6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SATB2Q9UPW6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SATB2Q9UPW6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms