Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRAK1Q9UPV9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
TRAK1Q9UPV9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
TRAK1Q9UPV9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TRAK1Q9UPV9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
TRAK1Q9UPV9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TRAK1Q9UPV9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TRAK1Q9UPV9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRAK1Q9UPV9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRAK1Q9UPV9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRAK1Q9UPV9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRAK1Q9UPV9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRAK1Q9UPV9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRAK1Q9UPV9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRAK1Q9UPV9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRAK1Q9UPV9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRAK1Q9UPV9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRAK1Q9UPV9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRAK1Q9UPV9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRAK1Q9UPV9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRAK1Q9UPV9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRAK1Q9UPV9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRAK1Q9UPV9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRAK1Q9UPV9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRAK1Q9UPV9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRAK1Q9UPV9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRAK1Q9UPV9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRAK1Q9UPV9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRAK1Q9UPV9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRAK1Q9UPV9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms