Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTF2Q9UNY4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTF2Q9UNY4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TTF2Q9UNY4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TTF2Q9UNY4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTF2Q9UNY4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTF2Q9UNY4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTF2Q9UNY4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTF2Q9UNY4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTF2Q9UNY4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TTF2Q9UNY4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTF2Q9UNY4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTF2Q9UNY4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TTF2Q9UNY4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms