Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRQQ9UMZ3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPRQQ9UMZ3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRQQ9UMZ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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