Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PALD1Q9ULE6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PALD1Q9ULE6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALD1Q9ULE6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms