Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TUBE1Q9UJT0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TUBE1Q9UJT0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms