Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DUX4Q9UBX2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUX4Q9UBX2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms