Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C6orf48Q9UBA6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C6orf48Q9UBA6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms