Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHPF2Q9P2E5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CHPF2Q9P2E5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHPF2Q9P2E5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms