Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTR3BQ9P1U1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTR3BQ9P1U1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTR3BQ9P1U1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTR3BQ9P1U1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTR3BQ9P1U1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTR3BQ9P1U1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTR3BQ9P1U1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTR3BQ9P1U1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTR3BQ9P1U1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTR3BQ9P1U1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTR3BQ9P1U1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTR3BQ9P1U1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTR3BQ9P1U1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms