Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDE1Q9NZC3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDE1Q9NZC3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
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