Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DLL3Q9NYJ7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DLL3Q9NYJ7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DLL3Q9NYJ7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms