Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PSD3Q9NYI0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSD3Q9NYI0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSD3Q9NYI0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms