Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SMPD3Q9NY59 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMPD3Q9NY59 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms