Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CWC25Q9NXE8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CWC25Q9NXE8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CWC25Q9NXE8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms