Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PAK1IP1Q9NWT1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAK1IP1Q9NWT1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PAK1IP1Q9NWT1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAK1IP1Q9NWT1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAK1IP1Q9NWT1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAK1IP1Q9NWT1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms