Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV64

TMEM39A, Transmembrane protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39AQ9NV64 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMEM39AQ9NV64 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM39AQ9NV64 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM39AQ9NV64 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms