Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LTBP3Q9NS15 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LTBP3Q9NS15 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LTBP3Q9NS15 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
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