Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VPS45Q9NRW7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS45Q9NRW7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS45Q9NRW7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms