Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPHK2Q9NRA0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPHK2Q9NRA0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPHK2Q9NRA0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms