Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NLRC4Q9NPP4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
NLRC4Q9NPP4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms