Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NGRNQ9NPE2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NGRNQ9NPE2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NGRNQ9NPE2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NGRNQ9NPE2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NGRNQ9NPE2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NGRNQ9NPE2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NGRNQ9NPE2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NGRNQ9NPE2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NGRNQ9NPE2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms