Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW0

BRF2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF2Q9HAW0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF2Q9HAW0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF2Q9HAW0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF2Q9HAW0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF2Q9HAW0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRF2Q9HAW0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF2Q9HAW0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF2Q9HAW0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF2Q9HAW0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF2Q9HAW0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF2Q9HAW0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF2Q9HAW0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF2Q9HAW0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF2Q9HAW0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF2Q9HAW0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRF2Q9HAW0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRF2Q9HAW0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF2Q9HAW0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF2Q9HAW0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF2Q9HAW0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF2Q9HAW0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF2Q9HAW0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF2Q9HAW0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF2Q9HAW0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRF2Q9HAW0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF2Q9HAW0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF2Q9HAW0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF2Q9HAW0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF2Q9HAW0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF2Q9HAW0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF2Q9HAW0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRF2Q9HAW0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms