Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP13A3Q9H7F0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP13A3Q9H7F0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP13A3Q9H7F0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms