Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NXF3Q9H4D5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NXF3Q9H4D5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms