Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PDCL3Q9H2J4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDCL3Q9H2J4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms