Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIOBPQ9H2D6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIOBPQ9H2D6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIOBPQ9H2D6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms