Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
YIPF3Q9GZM5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YIPF3Q9GZM5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms