Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BARHL1Q9BZE3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BARHL1Q9BZE3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms