Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPL4Q9BYD3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL4Q9BYD3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms