Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP58Q9BVL2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP58Q9BVL2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP58Q9BVL2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms