Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM62Q9BVG3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM62Q9BVG3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms