Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VAMP8Q9BV40 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VAMP8Q9BV40 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms