Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf16Q9BUW7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C9orf16Q9BUW7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms