Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NIPSNAP1Q9BPW8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms