Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP2Q99959 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms