Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA3Q99618 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDCA3Q99618 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDCA3Q99618 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 274.8 ms