Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RDH12Q96NR8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RDH12Q96NR8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RDH12Q96NR8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms