Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.27■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.27■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JSRP1Q96MG2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
JSRP1Q96MG2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
JSRP1Q96MG2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms