Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC17Q96LX7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC17Q96LX7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC17Q96LX7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms