Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ6

JPH4, Junctophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH4Q96JJ6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
JPH4Q96JJ6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
JPH4Q96JJ6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC37.63■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC37.61■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC37.6■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC37.58■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
JPH4Q96JJ6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms