Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCPIP1Q96JH7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VCPIP1Q96JH7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms