Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VSIG2Q96IQ7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VSIG2Q96IQ7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms