Protein–RNA interactions for Protein: Q96HH9

GRAMD2B, GRAM domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD2BQ96HH9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms