Protein–RNA interactions for Protein: Q96HH9

GRAMD2B, GRAM domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD2BQ96HH9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRAMD2BQ96HH9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GRAMD2BQ96HH9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms