Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIPA1Q96FS4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SIPA1Q96FS4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SIPA1Q96FS4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms